1. Проверить сторонними инструментами/сервисами - может, глюк Яндекса, а может, на хостинге что-то втихаря включили/отключили - было у меня такое на шареде.
2. Ошибка HTTP-протокола «406 Not Acceptable» означает, что формат или кодировка страницы не поддерживаются роботом. Если данная ошибка возникает при запуске индексации, то наиболее вероятная причина ее возникновения – главная страница Вашего сайта возвращает не поддерживаемый роботом тип контента.
ПС. Иногда можно на ровном месте найти проблему - сохранили с ВОМ, например или хедеры неправильные. А что ничего не проводилось - ну, тут такой момент - "все работало, а потом бац - и все поломалась". В общем, не аргумент - тут либо глюк Яндекса, либо что-то где-то как-то поменяли/поменялось.
Ещё короче - есть проблема, и надо решать, а что и кто и как - факультативно