У вас косяки в robots.txt.
1. Уберите все user-agent'ы, кроме первого, т.к. он один заменяет их всех.
2. В строке "User-agent: Googlebot-ImageDisallow: /administrator/" слились две строчки. Разделите их.
3. В ссылке на sitemap.xml после ".ru" идут два слеша подряд : Sitemap: mir-contenta.ru//sitemap.xml. Замените на один слеш.
4. Погуглите на тему "фильтры яндекса и как из под них выйти": agilify.ru/stat-seo/vyhod-iz-pod-filtra.html


В итоге robots.txt должен стать таким:

#=== robots.txt start ===

# If the Joomla site is installed within a folder such as at
# e.g. www.example.com/joomla/ the robots.txt file MUST be
# moved to the site root at e.g. www.example.com/robots.txt
# AND the joomla folder name MUST be prefixed to the disallowed
# path, e.g. the Disallow rule for the /administrator/ folder
# MUST be changed to read Disallow: /joomla/administrator/
#
# For more information about the robots.txt standard, see:
# www.robotstxt.org/orig.html
#
# For syntax checking, see:
# www.sxw.org.uk/computing/robots/check.html

User-agent: *
Disallow: /administrator/
Disallow: /cache/
Disallow: /cli/
Disallow: /components/
Disallow: /includes/
Disallow: /installation/
Disallow: /language/
Disallow: /libraries/
Disallow: /logs/
Disallow: /media/
Disallow: /modules/
Disallow: /plugins/
Disallow: /templates/
Disallow: /tmp/
Disallow: /*.pdf
Disallow: /*print=1
Disallow: /*mailto/

Sitemap: mir-contenta.ru/sitemap.xml

Host: mir-contenta.ru/
#=== robots.txt end ===

5. На всякий случай закройте все внешние ссылки в nofollow: к каждому тегу <a>, ведущему не на ваш сайт, добавьте атрибут rel="nofollow":
Powered by Phoca ( www.phoca.cz ) Gallery ( www.phoca.cz/phocagallery )
Powered by Warp Theme Framework ( www.yootheme.com )

На сайте нет тегов h1 h2 и тп, конечно это не критично я думаю, но их присутствие не помешает, особенно если они будут по смыслу подходить тегу title. 
И еще я не работал никогда с joomla, но вот лично меня смущает index.php в URL. Если уж сделан ЧПУ может избавится вообще от index.php и сделать ссылки не mir-contenta.ru/index.php/nashi-uslugi, а mir-contenta.ru/nashi-uslugi как-нибудь так.

robots.txt - главная проблема. А так, по сути, у вас сайт выглядит бесполезным для поиска в глазах поиска. Скажем так =)

Екатерина Диброва, что бы убрать из ссылки index.php, переименуйте в корне сайта файл htaccess.txt, что бы получилось .htaccess, и в настройках сайта Общие настройки - Использовать mod_rewrite, поставьте "Да".