Давайте рассуждать логически. Если сканеры больше не видят вируса, то это не значит, что его там нет. Согласен.Остальное всё можно вычистить полной перезаливкой ядра вашей cms - полность удаляем текущую, перезаливаем на аналогичную версию. Дерьма внутри в виде файлов мы исключаем, кроме сторонних модулей. Если данные модули взяты и официального репозитория, то проблем быть не с ними не должно, если нет, то их файлы надо удалять.
Следующая проблема это вирус в базе данных. Вирус в базе данных, как мне представляется, может нести нагрузку на оперативку и процессор, если такая есть и большая часть запросов через БД, то надо её смотреть и чистить. Но гуглу на вашу нагрузку наплевать, ему важна только скорость загрузки сайта. Но так как в данном случае adwords обнаружил вирус, то проблема здесь в исполняемых и отображаемых файлах, который мы должны были удалить на первом этапе очистки.
Хотел написать итог по пунктам, но здесь не так много действий. Поэтому, надо попробовать.
Как считаете, хорошая тактика?